燃料电池控制系统，是实现对整个燃料电池系统协调管理和过程控制的电子控制单元。燃料电池控制系统是燃料电池汽车传动系统的重要组成部分，其管理控制内容主要包括气路管理、水热管理、电气管理、数据通信、故障诊断等。
根据新思界产业研究中心发布的
《2026-2030年全球及中国燃料电池控制系统行业研究及十五五规划分析报告》显示，在燃料电池控制系统中，气路管理即氢气/空气管理，对燃料电池系统所需氢气和空气的湿度、流量、压力和温度进行控制；水热管理负责控制调节冷却水路的循环、加温、散热等；电气管理实现电堆电压和电流的检测、输出功率调节及电压电流保护等；数据通信负责与其他系统进行数据和控制指令的交互；故障诊断是对气路、水热、电气、通信等系统各环节进行故障检测、预警和保护。
燃料电池控制系统适用场景主要包括车用（氢燃料电池乘用车、商用车）、船用（内河船舶、沿海船舶、特种船舶）、无人机用（物流、测绘、巡检、军用无人机）、氢燃料电池发电站（分布式能源发电、备用电源、储能配套）等。现阶段，交通运输领域是燃料电池控制系统的最大应用市场，其中，汽车是核心应用场景，商用车是当前市场增长的主要动力。未来，燃料电池控制系统的新兴应用场景有望不断拓展，包括燃料电池船舶、燃料电池无人机、燃料电池发电站等方面。
我国燃料电池控制系统相关技术进展不断增多。从高校方面来看，武汉理工大学“燃料电池系统及整车高性能集成与智能控制技术”，燃料电池系统功率密度686W/kg，阴阳极压差控制精度≥98%，氢气利用率≥98%，并首创动态工况单体电压自修复技术，构建智能能量管理策略，该技术成果已经应用于上汽通用五菱、东风等车型。从企业方面来看，洺源科技（大连）有限公司自主研发的燃料电池控制器（FCU）响应速度为毫秒级，可实现-30℃低温启动，能够在复杂工况下稳定运行。
新思界
行业分析人士表示，我国燃料电池控制系统规范标准正在完善，将推动行业发展日益规范化。2025年8月，由天津荣程氢扬动力科技有限公司作为主要起草单位的团体标准《中重卡用氢燃料电池控制系统技术规范》（T/CIET 1409-2025）获批发布，规定了中重卡用燃料电池控制系统的系统构成、技术要求、试验方法、检验规则及标志、包装、运输和贮存等内容，适用于中重卡氢燃料电池汽车。
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