中国是化学原料药生产大国，尤其是发酵类药物产品的产能产量位居世界第一，约占全球产量的70%。而原料药生产过程中产生的“三废”量较大，废物成分复杂，污染危害严重，使得原料药企业面临的环保局势较为严峻，不断有药企因环保不达标被限产或停产。
2017年以来，环保部门加大了对京津冀及周边区域的督查力度，作为原料药主产地的山东、河北两省，也被列为重点督查对象。环保态势升级对原料药行业影响巨大，上述两个省份集中了多数有市场支配权和定价权的原料药企业，伴随着停产、限产政策的实施，原料药掀起了新一轮涨价潮，许多品种的价格已开始上调。在环保倒逼企业淘汰落后产能或进行大规模搬迁之际，由于企业搬迁耗资巨大且工期长。这个过程将改写市场竞争格局，加速行业整合。
同时，近年来相关环保标准与政策的陆续出台也开始“压制”原料药行业的生存空间。例如2015年4月“水十条”接踵而至，原料药制造被列为十大重点整治行业之一；2016年环境保护税法出台，此次将环保费改为环保税，对原料药这类高污染行业征收重税。在环境保护“十三五”规划中，要求原料药制造业推进行业达标排放改造。随着执法力度日趋严格，不少大型药企也不幸在环保问题上栽跟头。比如，哈药、云南制药、联邦制药、海正药业等都曾登上环保部门督查整改名单。有的企业整改后也难以达到标准，屡屡上榜。如联邦制药从2004年至今的十余年时间里，就有不下九次被环保部门点名批评。
原料价格轮番上涨，许多产品价格开始走出颓势，出现供不应求的态势。2017年1月，阿莫西林侧链对羟酸系列产品价格上扬，对羟酸报价涨到55元/公斤，系列产品同步上涨，羟邓盐甲酯75元/公斤。2017年6月7日，维生素D3的市场公开报价由69元/公斤上涨至82.5元/公斤，6月8日价格继续上涨至85元/公斤。
产能过剩及环保压力双向挤压原料药企业的生存环境，多数中小型企业的亏损面变宽，亏损额增多。环保红线的高压将使得无力进行环保投入的小型企业被淘汰出局。同时，环保标准的提升一定程度上推动原料药企业的转型升级。近年来，华海药业和海正药业等以挑战专利药、做特色原料药的企业，以及新兴的原料药企业等都逐步向制剂企业过渡，化学药品制剂企业资产总和和贡献率不断提升，达到30%以上。以海正药业为例，公司的原料药以抗肿瘤药物为主，其研发能力强。在制剂领域，抗肿瘤药物同样稀缺。海正药业的转型升级之路，就是在基于原料药的发展上强化制剂技术及研发能力，掌控上游较稀缺品种的合成技术，并积极开拓下游。
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医药行业分析人士表示，医药企业的治污费用很高，要花几个亿或者更多。以前在环保执法力度不够强时，企业往往宁意被罚款也不愿加大环保投入。如果环保督查及落实新环境法的力度进一步加大，不少污染大户都得关门，这将促使行业加速整合。
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