近年来，我国农业源污染排放已占到污染总排放量的，环保部表示我国“十三五”期间全国将新增完成13万个建制村环境综合整治。
随着我国经济的不断发展，工业化和城镇化进程速度加快，我国经济增长与环境污染的矛盾逐渐加深，目前，环境污染已成为危害人民健康的重大因素，“十三五”期间，环保治理将成为国家重点关注的问题。
造成环境的污染因素较多，而农业污染源污染排放已占到污染总排放量一半的份额，农村环境治理任务繁重，但也是国家必须重点关注的工作。目前我国九成以上农村环境基本处于无人管理的状态，农业污染未收到重视，也是目前农业污染问题频发的原因之一。
近年来，农村环境的治理工作逐渐受到重视，据数据显示，到2014年底，全国已有5.9万个村庄已开展环境综合整治，到2015年底，要完成7万个建制村的环境整治任务，“十三五”期间全国新增完成13万个建制村环境综合整治。
同时，针对一些地方建成项目缺乏管理，治污效果难以持续的问题，环保部将建立农村环境治理长效管护机制，同时探索财政资金政策与金融、价格、产业等政策手段形成合力，共同促进环境治理保护。
从长期来看，农村环境治理工作要形成一个长效运行机制，将农村污染源如污水，垃圾，畜禽粪便这些来整线统筹来考虑，这样才能将农村环境治理工作得到长期有效的进行。
