《太阳的后裔》于3月30日晚播出第十一集，该集收视率达到31.9%，较上一集（31.6%）提高0.3%，再次刷新自身收视率纪录，在11集剧情中，尹明珠终获疫苗死里逃生，阿古斯绑架了姜暮烟，柳时镇为救爱人独自行动。在第12集的预告中，阿古斯的人抓住一名儿童作人质威胁柳时镇放下手里的枪支，阿古斯的人紧接着拿枪对准了手无寸铁的柳时镇。
热门影视《太阳的后裔》的11集，尹明珠在徐大荣不顾一切冲进隔离室抱住自己的那一刻顿时明白了，受感染的是自己。一向矜持的徐大荣完全像变了一个人一样。
医疗中心被作为M3病毒治疗基地，受感染的病毒患者都被送到这里治疗，尹明珠也住进了病房里。住院治疗的尹明珠和被隔离的徐大荣此刻更感到生命的可贵和对彼此的牵挂，两人通过对讲机忘情而肆无忌惮地倾诉对对方的思念和担忧。
被隔离的宋医生，给海星医院的同仁发短信，让她帮自己查询一些医学资料传给自己供自己研究，并根据资料在病床上潜心研究治疗M3病毒的方法，最终研究出来了治疗方法，一种名为头孢噻肟的特效药。
突然停电，使治疗室陈永寿的呼吸机停止工作，陈永寿呼吸困难，口吐白沫，浑身抽搐。李致勋见状冲进来，按住拼命抽搐的陈永寿，而陈永寿临床的尹明珠更是反映迅速地准备镇定剂。就在尹明珠准备为陈永寿注射时，抓狂的陈永寿突然失控咬了李致勋一口。
李致勋没有顾及自己的伤口，而是全力以赴地为呼吸困难的陈永寿做心肺复苏，最终稳定了局面。致勋的表现被小姜发自肺腑的称赞，“是个优秀的医生”。那一刻李致勋心潮澎湃泪如雨下。
徐大荣等人被送去检验的血液样本结果出来了，幸运的都没有被感染。徐大荣被解除隔离后，第一时间去看望尹明珠。虽然隔着治疗室的玻璃门，但看到近在咫尺的爱人，徐大荣心里还是得到很大的安慰。
尹明珠的症状越来越严重，已经出现视力模糊的情况。知道自己病情不容乐观，她特意给父亲打电话告诉他，自己作为女儿为过去所做的忤逆父亲的事向他道歉，另外，她请求父亲不要逼徐大荣转业，因为她深爱徐大荣。
当尹明珠问及爸爸为什么没给自己打电话时，爸爸回答说：“据说生存率只有一半，作为父亲没什么能为你做的，作为司令官也没有可以下命令的，我无能为力”，语气听起来很是无奈。尹明珠打完电话后就晕倒了，姜暮烟等人对尹明珠展开了急救。柳时镇和徐大荣闻讯赶到，但他们都力不从心，唯有等运送疫苗和特效药物的车辆赶到。
姜暮烟这时接到丹尼尔电话，丹尼尔称他们运送药物的车辆被劫。就在柳时镇和徐大荣惊诧不已时，柳时镇突然接到阿古斯的电话。阿古斯提出让柳时镇拿钻石换疫苗。最终柳时镇拿到了疫苗，还把阿古斯的人给抓捕了。
尹明珠的病因为及时注射了药物终于转危为安，就在柳时镇等人以为尘埃落定时，柳时镇突然发现姜暮烟不见了。有人告诉他之前有警察来抓捕贩卖药物的帕蒂玛时带走了姜暮烟，柳时镇意识到出事了。
果然如柳时镇所料，阿古斯绑架了姜暮烟。阿古斯提出自己的军火交易晚上就要完成，一旦交易完成，美国人定然不会放过自己。所以，他要柳时镇确保自己安全脱身。柳时镇受制于人，虽恨的咬牙切齿，但投鼠忌器只能眼睁睁地看阿古斯带走姜暮烟。
就在柳时镇向上司提出要离开营救姜暮烟时，上司极力反对他擅自行动。连青瓦台的首席指挥官也不让他擅自行动。但时镇想到处在水深火热中的暮烟心如刀割，此刻他心里只有深爱的这个女人，其它一切都是浮云。最终决定孤胆英雄去拯救自己心爱的女人。
