3月19日，中国一艘渔船遭印尼武装船只攻击并扣留，中国海警前往协助。然而，3月21日，外媒报道称，一向在南海与中国并无主权争端的印尼突然态度强硬，将渔业纠纷上升到外交问题，就此事召见我国驻雅加达大使，要求中国做出说明。中国外交部于3月22日就此事给予了回应。
事情发展经过是这样的，3月19日下午，印尼执法船只在北纬5度5.866分，东经109度07.646分的海域发现一艘正在捕捞作业的中国广西渔船“桂北渔10078”号后开始追逐，随后登船将包括船长在内的9名中方人员抓捕，并拖带渔船驶向纳土纳群岛基地。印尼媒体报道称，印尼执法船返回纳土纳过程中，遭到急驶而来的中国海警阻挠警告并带走被扣留的“桂北渔10078”。
印尼渔业部长苏西·普吉亚斯图蒂(Susi Pudjiastuti)在雅加达表示，一艘中国渔船在印尼拥有主权水域“非法捕鱼”，当印尼准备扣押这艘渔船时，一艘中国海警船赶来阻止，印尼方面将召见中国驻雅加达大使，要求中方对中国海岸警卫队妨碍印尼扣留渔船一事作出说明。
对此事，3月22日，外交部发言人华春莹在例行记者会上表示，事发海域是中国传统渔场，中国渔船在此进行正常的生产作业。3月19日，有关渔船被印尼武装船只袭扰后，中国海警船前往施援，并未进入印尼领海。中方已于第一时间要求印尼方立即释放被扣押的中国渔民并保障其人身安全。希望印尼方从两国关系大局出发，妥善处理此次事件。
而且，华春莹还重申，印尼对中国南沙群岛没有提出领土要求。纳土纳群岛主权属于印尼，中方对此也无异议。对于双方在海上的分歧，应通过双边协商妥善解决。她还表示，渔业合作是中印尼互利合作的重要组成部分，中方一贯反对非法捕鱼，主张双方以建设性态度推进两国渔业合作，包括加强渔业管理和执法领域的交流与合作，妥善处理分歧问题。过去两天中，中印尼双方为妥善处理当前的渔业问题保持了密切沟通。
从地图上看，事发地点北纬5度5.866分，东经109度07.646分海域位于中国海洋权益主张线——九段线以内。距离印尼纳土纳群岛最大组成部分廖内群岛北端133公里，显然超出了印尼领海，处在印尼主张的专属经济区内。进行捕捞作业的中国渔船虽在九段线内，但距离西北方向的万安滩超过100公里，用国际海洋法公约概念来说也处于中国的专属区内。
国际军事专家表示，印尼显然自行扩大了专属区的权益，混淆了领海与专属区概念。渔船事件显然属于中国与印尼的围绕专属经济区的渔业资源纠纷。令事件升级的是印尼采取武力手段抓扣中国渔船。近年来，南海问题升温，与南海有关的各种问题泥沙俱下，周边国家在处理与中国争端时普遍使用强硬手段步步蚕食，借风生势。中国则以不变应万变，对南海填岛建设，扩大实际控制管理能力。此次，海警船接到求助后短时间赶到现场救回渔船体现了中国的常态化巡逻管控能力。
